말러 챔버 오케스트라는 1997년 클라우디오 아바도에 의해서 창단되었다. 그는 이 오케스트라를 통해 보다 더 자유스럽고 실험적인 분위기에서 바로크에서 현대음악까지 이르는 다양한 레퍼토리를 새롭게 재해석하고자 하였다.
2003년부터 현재에 이르기까지는 다니엘 하딩이 음악감독 겸 지휘를 맡고 있으며, 클라우디오 아바도와 마크 민코브스키가 객원 지휘자로 활동중이다.
오케스트라는 15개국에서 온 49명의 음악인들로 구성되어 있으며, 연간 70회에 달하는 공연을 소화하고 있다. 현재는 페라라 페스티벌, 엑상 프로방스, 루체른 페스티벌 등에서 상주 오케스트라로 활동하고 있으며, 2005년부터는 잘츠부르크의 모차르트 페스티벌에서도 상주 오케스트라로 초청되었다.
1998년 “페라라 무지카” 페스티벌의 탄생부터 함께해 온 말러 챔버 오케스트라는 페라라에서 매년 2차례의 공연 시리즈를 진행하고 있다. 클라우디오 아바도는 또한 페라라에서 뛰어난 오페라를 수차례 선보였는데 1999년에 팔스타프를, 2000년과 2004년에는 코지 판 투테, 2001년에 시몬 보카네그라를, 그리고 2005년에는 아바도 지휘로는 처음으로 모차르트 마술피리를 선보였다.
1998년 클라우디오 아바도와 다니엘 하딩의 지휘로 선보였던 돈 지오반니의 큰 성공으로 인해 말러 챔버 오케스트라는 엑상 프로방스 페스티벌의 상주 오케스트라가 된다. 이 공연의 실황은 버진에서 음반으로 출시 되기도 하였다.
말러 챔버 오케스트라는 또한 수많은 음반상을 수상하였는데, 2003년 고르띠에 까프숑과 함께한 “하이든 첼로 콘체르토”는 디아파종상과 쇼크상을 모두 수상하였으며, 도이치그라모폰을 통해 발매한 “심포니 판타지”는 jahrespreis der deutschen schallplattenkritik를 수상하였다.
이외에도 소프라노 막달레나 코체나와 함께한 프렌치 아리아, 르노 까프숑과 함께한 “슈만 & 멘델스존”, 소프라노 안나 넵트레코와 함께한 “이탈리안 아리아”, 피아니스트 마르타 아르헤리치가 참여한 베토벤 콘체르토 2번 & 3번 음반도 출시 되었다.